Mobius connaît des zones d'ombre depuis plusieurs décennies, notamment après l'attaque du Docteur Robotnik sur la ville de Mobotropolis il y a de cela 12 ans. La glorieuse cité du Royaume Acorn est désormais devenu le centre de l'empire qui ne cesse de s'étendre dans tous le pays et bientôt dans le monde entier. Un groupe de rebelles, les Freedom Fighters, se ligue contre les avancées mécaniques d'Eggman et de ses troupes armées. La bataille ne fait que commencer.

Rejoignez votre camp. Souhaiteriez-vous aider à combattre la tyrannie du Vil Docteur Eggman ou de combattre aux côtés de Sonic pour l'aider à sauver le monde de la robotisation ?